千野静のカリフォルニア通信

米国西海岸に在住の研究者のブログ

NGS解析: CuffdiffをiMacとWSで走らせてみたところ

RNA-Seq解析

 

24 core/Ubuntu 16.04/Custom PCでのRNA-Seq解析は4 core, Core i5/iMac での解析のおよそ5倍のスピードだった。

 

解析作業にそれぞれ16コアと2コアを割り当てた。

 

マシンパワーが解析時間の短縮に重要であると実感する。

 

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